木结构建筑在节能环保方面有着独特的优势，与其他结构相比，木结构建筑在空气污染和能源利用方面对环境的影响最小。木材的空气污染指数最低，钢结构的空气污染是木结构的1.7倍，混凝土结构的空气污染是木结构的2.2倍。就能耗而言，混凝土结构是木结构的2.2倍，钢结构是木结构的1.5倍。

木材是良好的电绝缘体，导电性低。即使采用一般的建造方法，木结构建筑的隔热效果也比空心砖墙建筑高3倍。相同厚度下，木材的保温值比标准混凝土高16倍，比钢高400倍，比铝高1600倍。如果加上一些隔热措施，木质建筑可以成为一个相对密封的空间，受外界气候、严寒酷暑等极端天气的影响很小。所以，木结构建筑就像一台天然空调，冬暖夏凉，四季如春。

木结构建筑是最适合人类居住的建筑，它的芬特明和负离子比钢筋混凝土建筑高出数百倍。多精和负离子能杀灭空气中的致病菌，使人远离疾病，对增强自身免疫能力、恢复人体机能、保持精神焕发、提高记忆力、降低血压、镇静情绪等有明显的作用。氡是一种放射性元素。如果长期吸入高浓度氡气，会造成上呼吸道和肺部损伤，甚至引发肺癌，对人体危害很大。氡气在水泥、砂石、砖块中形成后，会有一部分释放到空气中，成为钢筋混凝土建筑的隐形杀手。而木质建筑的氡散发量极低，对人体无害。据日本学者调查，木质民居的平均寿命比钢筋混凝土民居高9 ~ 11年，能使人更健康，寿命更长。