文化是以特定方式组织起来的符号系统。文化符号是指一个国家、一个民族、一个地区、一个群体、一个阶层具有丰富文化内涵和象征意义的载体。徽州古建筑的文化符号以其独特的建筑形式和丰富的文化内涵，在中国乃至世界建筑史上独树一帜。从建筑本体上来看，其中最具地域特色的文化符号，无疑是马头墙、天井、商字门和牌坊等，通过这些元素来表现徽派建筑的特色。

马头墙又称封火墙，主要是应民居密集而作防火、防风之需，在居宅的两山墙顶部砌筑的高出屋面的墙垣，因形似马头，故称马头墙。马头墙的马头，通常为“金印式”或“朝笏式”，折射出徽文化中的仕宦追求。徽州古建筑中的马头墙高低层叠，一般为两叠或三叠式，较大的民居可多至五叠，因此在徽文化中有“五岳朝天”的象征寓意。从高处向下看， 村落中高低起伏的马头墙如同涌动奔腾的马群，在赋予高大呆板的墙体以生动美感之外，又有生机勃发、兴旺发达的象征意味。

徽州民居的天井除了通风、采光、排水之外，还被赋予了风水、哲学、伦理等多重文化内涵，形成了丰富的象征意义。第一，聚敛财富的风水思想。在古徽州风水理论中，“天井”与“富贵”是密切相关的。回民不仅在建筑结构上设计了“四水归堂”的格局，即住宅房屋向四面天井排水，再通过天沟排出屋外，象征财源滚滚，肥水不流外人田，而且将石头地漏的格局雕刻成古代钱币的形状，寓意漏出来的雨水是财气之水。第二，天人合一的哲学思想。天井仿照徽州的地理环境。惠州的景观一般都是群山环抱，看起来像个盆地。天井的意思是“可以看到天空”，它将人与天空联系在一起，象征着人与自然环境的和谐。第三，具有严格礼仪制度的理学思想。当地的民居大多是根据天井带来的光照强度来布置的。二楼采光最好的明亮房间是祖堂，采光差的闺房，一楼客厅，然后是长房住宅。第四，族人共同生活的观念。徽州民居往往以天井为基本建筑单元，聚合成全家人的住宅，体现了“人不在乎姓”的地方宗族文化的影响。

另外，从建筑色彩来看，以黑、白、灰为主的徽州古建筑特有的色彩也是一种非常鲜明的文化符号，尤其是“粉墙瓦”，几乎成为了徽州建筑的色彩符号。以黑、白、灰为主的建筑色彩不仅体现了回族文化对典雅、朴素、简约、美观的崇尚，也成为回族建筑文化本身的独特标志。从室内装饰的角度来看，最显著的象征是徽州的三大雕刻——木雕、石雕和砖雕。这些雕刻不仅技艺精湛，具有很大的审美价值，而且具有丰富的文化内涵。可以看出，和徽州古村落的布局一样，徽州的许多古建筑元素已经超越了实物的本质，被赋予了丰富的文化内涵，具备了成为文化符号的基本条件。